Le sol de la basilique est un tapis de marbre de plus de 2 000 mètres carrés, avec des roues, des cercles entrelacés et des rayons de petits triangles en opus sectile, des panneaux de porphyre et de serpentine et des animaux comme des aigles en opus tessellatum. Posé surtout au XIIe siècle, il ondule aujourd'hui à cause du tassement des fondations sur le sol meuble de la lagune.