Un angle pavé de la troisième cour s'ouvre entre un long bâtiment blanc et, à droite, la mosquée des Agas, à coupole et assises de pierre et de brique, avec derrière les hauts murs du harem. Cette mosquée des officiers du palais abrite aujourd'hui la bibliothèque du palais, où furent transférés en 1928 les manuscrits de la bibliothèque d'Ahmed III.